RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 FSD2A1L4K1 749 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 KSR2Q6VAB6 950 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 COPS6Q7L5N1 327 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 TBC1D5Q92609 795 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 RIMBP2O15034 1052 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 TUBB4AP04350 444 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 IL2RBP14784 551 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SYNCQ9H7C4 482 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SYT1P21579 422 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SMC5Q8IY18 1101 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR70Q9NW82 654 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 TYRO3Q06418 890 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 TICAM2Q86XR7 235 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 PHACTR2O75167 634 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 B4DLN1 442 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP85Q6P2H3 762 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SPTLC2O15270 562 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 AK2P54819 239 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 PSMA7O14818 248 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 SPAG5Q96R06 1193 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 DCTPP1Q9H773 170 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD28-201ENST00000399451 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.33■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 GNAQP50148 359 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 DDX12PQ92771 950 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 CALM1P0DP23 149 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 CALM2P0DP24 149 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 CALM3P0DP25 149 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 CTAGE9A4FU28 777 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 PLVAPQ9BX97 442 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RTL9Q8NET4 1388 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 DHX58Q96C10 678 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 EYA3Q99504 573 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TACC1O75410 805 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 NAPAP54920 295 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 USP37Q86T82 979 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA1Q92805 767 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 ASIC1P78348 528 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 HS1BP3Q53T59 392 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RUFY3Q7L099 469 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TNNQ9UQP3 1299 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT83P78385 493 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM75PA6NK02 468 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TIGD1Q96MW7 591 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 ACTN2P35609 894 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT13P13646 458 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms