RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 ABCA3Q99758 1704 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GUL7 405 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CTAGE5O15320 804 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 LRRC24Q50LG9 513 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 MAST3O60307 1309 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CTDNEP1O95476 244 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CIAO1O76071 339 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ATL3Q6DD88 541 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 A1BGP04217 495 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 GORABQ5T7V8 394 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ARID3AQ99856 593 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ATG3Q9NT62 314 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 GLI3P10071 1580 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 KINO60870 393 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 STX1AQ16623 288 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 M0R2C6 588 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CHST3Q7LGC8 479 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 USP28Q96RU2 1077 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CPDO75976 1380 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 A0A0G2JLW4 131 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ME1P48163 572 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 GUCY1B3Q02153 619 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 TSC1Q92574 1164 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PPFIA3O75145 1194 aa15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 WASHC4Q2M389 1173 aa15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.34■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 BECN2A8MW95 431 aa15.33■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 LRMPQ12912 555 aa15.33■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.33■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.33■□□□□ 0.05
PRAME-201ENST00000398741 CDC25BP30305 580 aa15.33■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.33■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 FSIP1Q8NA03 581 aa15.33■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 OSBP2Q969R2 916 aa15.33■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 IQCB1Q15051 598 aa15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 ANO10Q9NW15 660 aa15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 SARM1Q6SZW1 724 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 XAGE2Q96GT9 111 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 ZMYND15Q9H091 742 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 FAM177BA6PVY3 158 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 HAND2P61296 217 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 FBXL16Q8N461 479 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 FBXO3Q9UK99 471 aa15.31■□□□□ 0.04
PRAME-201ENST00000398741 TJP1Q07157 1748 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms