RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 SLC27A2O14975 620 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ME3Q16798 604 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 BRF1Q92994 677 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 DACT1Q9NYF0 836 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CPDO75976 1380 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF790Q6PG37 636 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ANKRD7Q92527 254 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 IL25Q9H293 177 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 TRIM29Q14134 588 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 STX1AQ16623 288 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 HAUS7Q99871 368 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 IKBKBO14920 756 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 IGKV5-2P06315 115 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ATP8B1O43520 1251 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PSME1Q06323 249 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PPP2R5BQ15173 497 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF75DP51815 510 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RESTQ13127 1097 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 IQCB1Q15051 598 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 STK38Q15208 465 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZBTB22O15209 634 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ADALQ6DHV7 355 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PEAK1Q9H792 1746 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ME1P48163 572 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 DMTNQ08495 405 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZBTB9Q96C00 473 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 H7C1W4 665 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SEMA3FQ13275 785 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CDKL5O76039 1030 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PTH1RQ03431 593 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CERS3Q8IU89 383 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SHTN1A0MZ66 631 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ST3GAL1Q11201 340 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 PDIA6Q15084 440 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 TNNI3KQ59H18 835 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ERO1AQ96HE7 468 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 EYA2O00167 538 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CASQ1P31415 396 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 SUCLG2Q96I99 432 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 ZMYM6O95789 1325 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CBFA2T2O43439 604 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-205ENST00000397611 CYP21A2P08686 494 aa6.29□□□□□ -1.4
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