RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 FOSBP53539 338 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 MAST3O60307 1309 aa22.13■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.12■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 EYA2O00167 538 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 LRRC24Q50LG9 513 aa22.11■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.09■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 A0A1B0GUL7 405 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 M0R2C6 588 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 ATF3P18847 181 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.09■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 ATG3Q9NT62 314 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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CBX1-202ENST00000393408 CHST3Q7LGC8 479 aa22.08■■□□□ 1.12
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CBX1-202ENST00000393408 EVCP57679 992 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX1-202ENST00000393408 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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CBX1-202ENST00000393408 ANKRD7Q92527 254 aa22.05■■□□□ 1.12
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CBX1-202ENST00000393408 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.03■■□□□ 1.12
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CBX1-202ENST00000393408 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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CBX1-202ENST00000393408 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CBX1-202ENST00000393408 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CBX1-202ENST00000393408 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CBX1-202ENST00000393408 NEMFO60524 1076 aa22.01■■□□□ 1.11
CBX1-202ENST00000393408 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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CBX1-202ENST00000393408 A0A1W2PQ27 194 aa22■■□□□ 1.11
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