RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BMP4P12644 408 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CANXP27824 592 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GJA8P48165 433 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPP2R3AQ06190 1150 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PAK2Q13177 524 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SOGA3Q5TF21 947 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TPTE2Q6XPS3 522 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRPM4Q8TD43 1214 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TCF12Q99081 682 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SLC30A3Q99726 388 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RSRP1Q9BUV0 290 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IGFLR1Q9H665 355 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COPRSQ9NQ92 184 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DZANK1Q9NVP4 752 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SAMM50Q9Y512 469 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 THBS1P07996 1170 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ITPKAP23677 461 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LIG3P49916 1009 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SIK1P57059 783 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAP3K11Q16584 847 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SYT9Q86SS6 491 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CEP120Q8N960 986 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMEM74Q96NL1 305 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GMLQ99445 158 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PBX4Q9BYU1 374 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A096LPE4 126 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A1W2PPZ6 126 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MINDY4BA8MYZ0 360 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SIN3BO75182 1162 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ACPPP15309 386 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PTPRAP18433 802 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ADH6P28332 368 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GRIA4P48058 902 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GRIN2CQ14957 1233 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SV2AQ7L0J3 742 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM35AQ86V20 835 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MCF2L2Q86YR7 1114 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CKAP2LQ8IYA6 745 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NXPE3Q969Y0 559 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF576Q9H609 170 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMEM39AQ9NV64 488 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 STRIP2Q9ULQ0 834 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 METTL12A8MUP2 240 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 F6X3S4 739 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 J3QW42 95 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GPR25O00155 361 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CELA3AP09093 270 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FGRP09769 529 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CPB1P15086 417 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MX2P20592 715 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CABP4P57796 275 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATP11AP98196 1134 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LMNB2Q03252 620 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 APOBRQ0VD83 1088 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPRED3Q2MJR0 410 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CEP135Q66GS9 1140 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HFE2Q6ZVN8 426 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DPH6Q7L8W6 267 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms