RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.62■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.62■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.053e-12■■■■■ 43.2
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USP11-202ENST00000377078 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.61■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 CST9Q5W186 159 aa21.61■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.61■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 OGFOD1Q8N543 542 aa21.61■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.61■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 USP48Q86UV5 1035 aa21.6■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 SULF1Q8IWU6 871 aa21.6■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 SUCLG2Q96I99 432 aa21.6■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.6■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 PSME4Q14997 1843 aa21.59■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 DACT2Q5SW24 774 aa21.58■■□□□ 1.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.58■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 GGA3Q9NZ52 723 aa21.58■■□□□ 1.05
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USP11-202ENST00000377078 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.57■■□□□ 1.04
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USP11-202ENST00000377078 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.57■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 CAPNS2Q96L46 248 aa21.57■■□□□ 1.04
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USP11-202ENST00000377078 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 GRM1Q13255 1194 aa21.56■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 SCARF1Q14162 830 aa21.56■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.56■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.56■■□□□ 1.04
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USP11-202ENST00000377078 IFFO2Q5TF58 517 aa21.55■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 CD209Q9NNX6 404 aa21.55■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 GTF2IP78347 998 aa21.54■■□□□ 1.04
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USP11-202ENST00000377078 KAZALD1Q96I82 304 aa21.54■■□□□ 1.04
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USP11-202ENST00000377078 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.54■■□□□ 1.04
USP11-202ENST00000377078 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.54■■□□□ 1.04
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USP11-202ENST00000377078 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 WBP1LQ9NX94 342 aa21.51■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 IL1R1P14778 569 aa21.5■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 MAP2K2P36507 400 aa21.5■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.5■■□□□ 1.03
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USP11-202ENST00000377078 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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USP11-202ENST00000377078 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.49■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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USP11-202ENST00000377078 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
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USP11-202ENST00000377078 DLK2Q6UY11 383 aa21.47■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 TNS4Q8IZW8 715 aa21.47■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.47■■□□□ 1.03
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USP11-202ENST00000377078 NOGQ13253 232 aa21.46■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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