RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 OGFOD1Q8N543 542 aa29.68■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 ZIC5Q96T25 663 aa29.68■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 SLC10A3P09131 477 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 FLIIQ13045 1269 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 GCKRQ14397 625 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 PSME4Q14997 1843 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 LINS1Q8NG48 757 aa29.65■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 G2E3Q7L622 706 aa29.64■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.64■■■□□ 2.34
C9orf47-202ENST00000375850 RGS19P49795 217 aa29.63■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 CCDC184Q52MB2 194 aa29.63■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 DACT2Q5SW24 774 aa29.63■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.63■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 ITGA6P23229 1130 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 DGKZQ13574 1117 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 WDR63Q8IWG1 891 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 MYH3P11055 1940 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 CSF1RP07333 972 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 RNF186Q9NXI6 227 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.59■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 CASP7P55210 303 aa29.59■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 MRS2Q9HD23 443 aa29.59■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 FAM161AQ3B820 660 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 CSRNP1Q96S65 589 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf47-202ENST00000375850 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 NF2P35240 595 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 FBXW7Q969H0 707 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.56■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 WNT10BO00744 389 aa29.56■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 TRPA1O75762 1119 aa29.56■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 KCNJ4P48050 445 aa29.56■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.56■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 VAMP4O75379 141 aa29.55■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.54■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.54■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 ANP32CO43423 234 aa29.53■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 CHRNDQ07001 517 aa29.53■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
C9orf47-202ENST00000375850 MXD3Q9BW11 206 aa29.51■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 CACNA1FO60840 1977 aa29.51■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 CD209Q9NNX6 404 aa29.5■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 GTF2IP78347 998 aa29.49■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 SPEF2Q9C093 1822 aa29.49■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 KLRK1P26718 216 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 BEND3Q5T5X7 828 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 SASH1O94885 1247 aa29.47■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.46■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 FOXO4P98177 505 aa29.46■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.46■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.45■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 MOB2Q70IA6 237 aa29.45■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 MTMR14Q8NCE2 650 aa29.45■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
C9orf47-202ENST00000375850 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 TM4SF4P48230 202 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 SREBF2Q12772 1141 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 DLGAP5Q15398 846 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.44■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 GRM8O00222 908 aa29.43■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 IL1R1P14778 569 aa29.43■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 F6X3S4 739 aa29.42■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 MYO1BO43795 1136 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 TAF5LO75529 589 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 ALDH1L1O75891 902 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.4■■■□□ 2.3
C9orf47-202ENST00000375850 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms