RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 STYK1Q6J9G0 422 aa24.79■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.79■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 KCNJ4P48050 445 aa24.79■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.79■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 C21orf2O43822 256 aa24.78■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 SEC24BO95487 1268 aa24.78■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 SLC5A1P13866 664 aa24.78■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 SPON1Q9HCB6 807 aa24.78■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 SP8Q8IXZ3 490 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 UFL1O94874 794 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 ATP5JP18859 108 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 MCAMP43121 646 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 GPATCH3Q96I76 525 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.77■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 XDHP47989 1333 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 UBE4AQ14139 1066 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 JAG2Q9Y219 1238 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.76■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.75■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 ERC2O15083 957 aa24.75■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 CNKSR1Q969H4 720 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 AOX1Q06278 1338 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 C6orf229H3BNL8 230 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 RIMBP2O15034 1052 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 ZAP70P43403 619 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 TTLL6Q8N841 843 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.74■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 GOLIM4O00461 696 aa24.73■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 RASGRF1Q13972 1273 aa24.73■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.73■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 GGA1Q9UJY5 639 aa24.73■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.72■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 TGFB2P61812 414 aa24.72■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 MPNDQ8N594 471 aa24.72■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 HAUS7Q99871 368 aa24.72■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 IL25Q9H293 177 aa24.72■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 BACH2Q9BYV9 841 aa24.71■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.71■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.71■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.71■■□□□ 1.55
TMCO3-201ENST00000375391 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.7■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.7■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.7■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 VPS37DQ86XT2 251 aa24.7■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 PIM2Q9P1W9 311 aa24.7■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.7■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.69■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 LTBP1Q14766 1721 aa24.68■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.68■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 ATP2B4P23634 1241 aa24.68■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.68■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.68■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 SOCS7O14512 581 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 TMC4Q7Z404 712 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CNTROBQ8N137 903 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 BCS1LQ9Y276 419 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 DOK7Q18PE1 504 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 SPATA5Q8NB90 893 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.67■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 SNED1Q8TER0 1413 aa24.66■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 WASHC4Q2M389 1173 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 EVI5LQ96CN4 794 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 FSD1Q9BTV5 496 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CDC45O75419 566 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CHMLP26374 656 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 FAM227BQ96M60 508 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.65■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TMCO3-201ENST00000375391 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 AOC3Q16853 763 aa24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 SYT17Q9BSW7 474 aa24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 CD209Q9NNX6 404 aa24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms