RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP2B4P23634 1241 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 UBE4AQ14139 1066 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP2B3Q16720 1220 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A1B0GUL7 405 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 MX1P20591 662 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 TIMM10P62072 90 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 LPIN2Q92539 896 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 C6orf229H3BNL8 230 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 AACSQ86V21 672 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 PSMD1Q99460 953 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC5A1P13866 664 aa24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 KLRK1P26718 216 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 STAP2Q9UGK3 403 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 NFKBIEO00221 500 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 ADORA1P30542 326 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 XAGE2Q96GT9 111 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 GPR162Q16538 588 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 MED23Q9ULK4 1368 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 AOX1Q06278 1338 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 WASHC4Q2M389 1173 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 EYA3Q99504 573 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 CDC45O75419 566 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 SDSP20132 328 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-204ENST00000373436 GYG1P46976 350 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 RIMBP2O15034 1052 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 RASSF7Q02833 373 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 BCAMP50895 628 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 GORABQ5T7V8 394 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 AOC3Q16853 763 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 SBF1O95248 1867 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 PPIP5K2O43314 1243 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC102BQ68D86 513 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 PHKA1P46020 1223 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 VPS37DQ86XT2 251 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 VPS33BQ9H267 617 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 CHD4Q14839 1912 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 COL4A5P29400 1685 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 GRIN3BO60391 1043 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 PRELPP51888 382 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 DOK7Q18PE1 504 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 GPATCH3Q96I76 525 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-204ENST00000373436 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 COA1Q9GZY4 146 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 CD209Q9NNX6 404 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 G3V3G9 751 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 RILPL2Q969X0 211 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms