RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D8O95759 1140 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 NF2P35240 595 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTSWP56202 376 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 MED23Q9ULK4 1368 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 DACT2Q5SW24 774 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL16Q14005 1332 aa24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 TM4SF4P48230 202 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 WNT10BO00744 389 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMP14P50281 582 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXW7Q969H0 707 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 MXD3Q9BW11 206 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 COA1Q9GZY4 146 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 SREBF2Q12772 1141 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 KSR2Q6VAB6 950 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 GREM2Q9H772 168 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR25O00155 361 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGKV5-2P06315 115 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR63Q8IWG1 891 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSME4Q14997 1843 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 SASH1O94885 1247 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 FKTNO75072 461 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRKG1Q13976 671 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPYL6Q8N831 410 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 STK31Q9BXU1 1019 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 H7C1W4 665 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCER2I3L3R5 266 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALDH1A1P00352 501 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTF2IP78347 998 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPRYD7Q5W111 196 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITGA6P23229 1130 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNJ4P48050 445 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 INHBEP58166 350 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLRK1P26718 216 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 DLGAP5Q15398 846 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC4A2P04920 1241 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 GCKRQ14397 625 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD209Q9NNX6 404 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSF1RP07333 972 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHRNDQ07001 517 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K11Q16584 847 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 G2E3Q7L622 706 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFNL1Q8IU54 200 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 FZD1Q9UP38 647 aa24.39■■□□□ 1.49
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