RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLF15Q9UIH9 416 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 H7C1W4 665 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIF4AO95239 1232 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 EDN3P14138 238 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CPB1P15086 417 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNMA1Q12791 1236 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP120Q8N960 986 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 FRMD6Q96NE9 622 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCL11AQ9H165 835 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC3BQ9H195 1237 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDC25BP30305 580 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GSTT1P30711 240 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 HYAL2Q12891 473 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAK2Q13177 524 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 HGSNATQ68CP4 663 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCNJLQ8IV13 435 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 BMP4P12644 408 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIK1P57059 783 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAMC2Q13753 1193 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 STK35Q8TDR2 534 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 NXPE3Q969Y0 559 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRC1Q96MC2 740 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERBB4Q15303 1308 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A096LPE4 126 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PPZ6 126 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENC1O14682 589 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GIPC1O14908 333 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP3K6O95382 1288 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOX18P35713 384 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 NRLP54845 237 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPLD1P80108 840 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PERM1Q5SV97 790 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP135Q66GS9 1140 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SV2AQ7L0J3 742 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM35AQ86V20 835 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF576Q9H609 170 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC31BQ9NQW1 1179 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PF4P02776 101 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GARTP22102 1010 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRKP46108 304 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GSK3AP49840 483 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIG3P49916 1009 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 KANK3Q6NY19 840 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PHC3Q8NDX5 983 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO27Q8NI29 283 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUDT8Q8WV74 236 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PMEPA1Q969W9 287 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLD4Q96BZ4 506 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.7 ms