RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 MICALL2Q8IY33 904 aa18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 COA1Q9GZY4 146 aa18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.69■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 HTRA3P83110 453 aa18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 DPF2Q92785 391 aa18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.68■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L3A6NCW0 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L4A6NCW7 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 METTL24Q5JXM2 366 aa18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 MXD3Q9BW11 206 aa18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF609O15014 1411 aa18.66■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 EGFRP00533 1210 aa18.66■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 UBE4AQ14139 1066 aa18.66■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 FBXW7Q969H0 707 aa18.66■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CD209Q9NNX6 404 aa18.66■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.66■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CEP350Q5VT06 3117 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 EYA2O00167 538 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 APLP1P51693 650 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 DACT2Q5SW24 774 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 PANK1Q8TE04 598 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 GMLQ99445 158 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 SIL1Q9H173 461 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.65■□□□□ 0.58
CSAG1-201ENST00000361211 H7C1D1 291 aa18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 GNAI2P04899 355 aa18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MTX1Q13505 466 aa18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CNTROBQ8N137 903 aa18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PASKQ96RG2 1323 aa18.64■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PDE8BO95263 885 aa18.63■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 GYG1P46976 350 aa18.63■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2IP78347 998 aa18.63■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.63■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.63■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.63■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SRGAP3O43295 1099 aa18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 IL1R1P14778 569 aa18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 JAG2Q9Y219 1238 aa18.62■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CIAO1O76071 339 aa18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FGFR2P21802 821 aa18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 COPRSQ9NQ92 184 aa18.61■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CERS5Q8N5B7 392 aa18.6■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.6■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO3Q9UK99 471 aa18.6■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TRAF5O00463 557 aa18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L8P0C7I0 530 aa18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CSAG1-201ENST00000361211 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.58■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 BCAMP50895 628 aa18.57■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.57■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.57■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.57■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 COG6Q9Y2V7 657 aa18.57■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SLC5A1P13866 664 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 POLA2Q14181 598 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DLK2Q6UY11 383 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 LPIN2Q92539 896 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CSAG1-201ENST00000361211 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms