RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 NECAB1Q8N987 351 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 OSBP2Q969R2 916 aa21.35■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 M0R2C6 588 aa21.35■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 PDE8BO95263 885 aa21.35■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 WASHC4Q2M389 1173 aa21.35■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.34■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 BCAMP50895 628 aa21.33■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 ANAPC15P60006 121 aa21.33■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.33■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 CHST3Q7LGC8 479 aa21.33■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 MED23Q9ULK4 1368 aa21.33■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 TTC14Q96N46 770 aa21.33■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 HAND2P61296 217 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC102BQ68D86 513 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC12Q96J65 1359 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 ZPR1O75312 459 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 STK3Q13188 491 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 GPR108Q9NPR9 543 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.32■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 NPHP1O15259 732 aa21.31■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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PDE4D-204ENST00000358923 CYP21A2P08686 494 aa21.31■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.31■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.31■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 BTAF1O14981 1849 aa21.31■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 JAG2Q9Y219 1238 aa21.3■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 DYNC1I1O14576 645 aa21.3■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.3■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.3■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 HIP1O00291 1037 aa21.3■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 RPS6KA4O75676 772 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 KLRK1P26718 216 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 CHRNDQ07001 517 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 PARP10Q53GL7 1025 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 SETDB2Q96T68 719 aa21.29■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
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PDE4D-204ENST00000358923 GYG1P46976 350 aa21.27■■□□□ 1
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PDE4D-204ENST00000358923 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 MCTP1Q6DN14 999 aa21.27■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 NARFQ9UHQ1 456 aa21.27■■□□□ 1
PDE4D-204ENST00000358923 RASGRF1Q13972 1273 aa21.27■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ME3Q16798 604 aa21.27■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.27■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.27■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 AK7Q96M32 723 aa21.27■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ST3GAL1Q11201 340 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 FOXP2O15409 715 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.26■□□□□ 0.99
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PDE4D-204ENST00000358923 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.26■□□□□ 0.99
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PDE4D-204ENST00000358923 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
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PDE4D-204ENST00000358923 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.23■□□□□ 0.99
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