RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa12□□□□□ -0.49
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CLN8-201ENST00000331222 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.96□□□□□ -0.49
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CLN8-201ENST00000331222 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.96□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 E7EVH7 732 aa11.95□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 PSMD6Q15008 389 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 DAAM2Q86T65 1068 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 BIRC3Q13489 604 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 DDB1Q16531 1140 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 KRT2P35908 639 aa11.95□□□□□ -0.5
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