RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 OGFOD1Q8N543 542 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 H7C1W4 665 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 KCNJ4P48050 445 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 GCKRQ14397 625 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 CDCA5Q96FF9 252 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 ITGA6P23229 1130 aa29.71■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.71■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.71■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 WDR63Q8IWG1 891 aa29.7■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 LINS1Q8NG48 757 aa29.7■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 COA1Q9GZY4 146 aa29.7■■■□□ 2.35
TMEM54-201ENST00000329151 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.69■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 FAM161AQ3B820 660 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 GMLQ99445 158 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.66■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.66■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 FKBP1BP68106 108 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 ZIC5Q96T25 663 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 NF2P35240 595 aa29.64■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 VAMP4O75379 141 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 MMP14P50281 582 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 DACT2Q5SW24 774 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.62■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 SLC10A3P09131 477 aa29.62■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.62■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.62■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 CSF1RP07333 972 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 DGKZQ13574 1117 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 MXD3Q9BW11 206 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 CHRNDQ07001 517 aa29.6■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.6■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 TRPA1O75762 1119 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 CASP7P55210 303 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 GTF2IP78347 998 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM54-201ENST00000329151 F6X3S4 739 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 WNT10BO00744 389 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 SASH1O94885 1247 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.55■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 RNF186Q9NXI6 227 aa29.55■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 KLRK1P26718 216 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 TAF5LO75529 589 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 BEND3Q5T5X7 828 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 CSRNP1Q96S65 589 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 CD209Q9NNX6 404 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 GRM8O00222 908 aa29.52■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.52■■■□□ 2.32
TMEM54-201ENST00000329151 PLIN1O60240 522 aa29.51■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 DLGAP5Q15398 846 aa29.51■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.51■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 FOXO4P98177 505 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 MOB2Q70IA6 237 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 MYO1BO43795 1136 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 A0A1B0GUL6 1792 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 ALDH1L1O75891 902 aa29.47■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 PRKG1Q13976 671 aa29.47■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 SNAP23O00161 211 aa29.46■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 F8W031 263 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms