RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 MMP14P50281 582 aa15.57■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 KRT24Q2M2I5 525 aa15.57■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.57■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.57■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 INHBEP58166 350 aa15.56■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.56■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 PDE8AO60658 829 aa15.55■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.54■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 WNT10BO00744 389 aa15.54■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 GOLGA2Q08379 1002 aa15.54■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 TRIM17Q9Y577 477 aa15.54■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 COL4A1P02462 1669 aa15.54■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 NEUROD2Q15784 382 aa15.53■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 SPRYD7Q5W111 196 aa15.53■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.53■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.53■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 KCNA4P22459 653 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 PRKG1Q13976 671 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 DACT2Q5SW24 774 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 FBXW7Q969H0 707 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SPC25-201ENST00000282074 PSME4Q14997 1843 aa15.52■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.51■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.51■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 MYD88Q99836 296 aa15.51■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 COA1Q9GZY4 146 aa15.51■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 POTEFA5A3E0 1075 aa15.5■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 IFNL1Q8IU54 200 aa15.5■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 ERO1AQ96HE7 468 aa15.5■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 MED23Q9ULK4 1368 aa15.5■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 MXD3Q9BW11 206 aa15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 SASH1O94885 1247 aa15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.49■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 UNCXA6NJT0 531 aa15.48■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.48■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.48■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 MAP3K11Q16584 847 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 EFCC1Q9HA90 598 aa15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 CTSWP56202 376 aa15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 ARMC5Q96C12 935 aa15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 RUNDC1Q96C34 613 aa15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.46■□□□□ 0.07
SPC25-201ENST00000282074 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 ARHGEF6Q15052 776 aa15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 RALBP1Q15311 655 aa15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 DLGAP5Q15398 846 aa15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 WNK4Q96J92 1243 aa15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 GTF2IP78347 998 aa15.44■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 SP3Q02447 781 aa15.44■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.44■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 MBIPQ9NS73 344 aa15.44■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 MYO1BO43795 1136 aa15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 CRHR2Q13324 411 aa15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 NBPF11Q86T75 865 aa15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 GREM2Q9H772 168 aa15.43■□□□□ 0.06
SPC25-201ENST00000282074 FZD1Q9UP38 647 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms