RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 GOLIM4O00461 696 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 MCAMP43121 646 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 PI16Q6UXB8 463 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 XDHP47989 1333 aa21.61■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 H0YIN7 160 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 CHRNA5P30532 468 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 BCAMP50895 628 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 MTFR1LQ9H019 292 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 KLRK1P26718 216 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ALDH1B1P30837 517 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 GPSM2P81274 684 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 DOCK2Q92608 1830 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 GYG1P46976 350 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ILDR2Q71H61 639 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 TMC4Q7Z404 712 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ZAP70P43403 619 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 STYK1Q6J9G0 422 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-201ENST00000259239 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 IL25Q9H293 177 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 RASGRF1Q13972 1273 aa21.57■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 SP8Q8IXZ3 490 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 POLD1P28340 1107 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 HIP1O00291 1037 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 UFL1O94874 794 aa21.55■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 VPS37DQ86XT2 251 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.55■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.55■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 GGA1Q9UJY5 639 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 FAM227BQ96M60 508 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 A0A0D9SFI3 127 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 REC8O95072 547 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 ATP2B4P23634 1241 aa21.53■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-201ENST00000259239 POLLQ9UGP5 575 aa21.52■■□□□ 1.04
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IMP4-201ENST00000259239 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.51■■□□□ 1.03
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IMP4-201ENST00000259239 DPEP1P16444 411 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.5■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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IMP4-201ENST00000259239 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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IMP4-201ENST00000259239 C6orf229H3BNL8 230 aa21.49■■□□□ 1.03
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IMP4-201ENST00000259239 RAD50Q92878 1312 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 CHD4Q14839 1912 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 MED23Q9ULK4 1368 aa21.49■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 TICAM2Q86XR7 235 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-201ENST00000259239 SEMA3EO15041 775 aa21.47■■□□□ 1.03
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