RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	ATRAID	Q6UW56	229 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	STX12	Q86Y82	276 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	LRP3	O75074	770 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	BGLAP	P02818	100 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CASR	P41180	1078 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB32	Q13637	225 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NUBPL	Q8TB37	319 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	SGCZ	Q96LD1	299 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL2L11	O43521	198 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	PIGM	Q9H3S5	423 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	SNAPIN	O95295	136 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CCR5	P51681	352 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ESX1	Q8N693	406 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NPAS1	Q99742	590 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PPC1	479 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	HMSD	A8MTL9	139 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CHRM2	P08172	466 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NR2C1	P13056	603 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	EDN3	P14138	238 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	RRAD	P55042	308 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB5B	P61020	215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	PNLIP	P16233	465 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	DUSP1	P28562	367 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	MASP2	O00187	686 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CD79A	P11912	226 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CXCL12	P48061	93 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA40	Q86UY6	237 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NAXD	Q8IW45	347 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF721	Q8TF20	911 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC9	Q92623	222 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	DDAH2	O95865	285 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525		P04436	131 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	VASH2	Q86V25	355 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	PIAS2	O75928	621 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	TUBG1	P23258	451 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	CPT2	P23786	658 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	S100G	P29377	79 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2B8P	P59922	312 aa		10.46	□□□□□ -0.73

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