RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CD84Q9UIB8 345 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.54□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0B4J2E0 115 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TVP23AA6NH52 213 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 K7EN84 100 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 FABP3P05413 133 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CD37P11049 281 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OMGP23515 440 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PPICP45877 212 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CYB561P49447 251 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 UBE2AP49459 152 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PRLHRP49683 370 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 HCCSP53701 268 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR2B8PP59922 312 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP1CBP62140 327 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 STPG2Q8N412 459 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC29Q8WV35 223 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 GTF2H4Q92759 462 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ARL5BQ96KC2 179 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 COPS4Q9BT78 406 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGEF11O15085 1522 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 GRIN2AQ12879 1464 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SMARCA2-241ENST00000635397 HFM1A2PYH4 1435 aa3.53□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 MYOM3Q5VTT5 1437 aa3.53□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ITSN2Q9NZM3 1697 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ROCK1Q13464 1354 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 MTUS2Q5JR59 1369 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 NESP48681 1621 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 F8VP50 259 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 H7C417 338 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 SNAI2O43623 268 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 SCN2BO60939 215 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 CBR3O75828 277 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 GLAP06280 429 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 MYL9P24844 172 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 GNRHRP30968 328 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 CEACAM6P40199 344 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 CRATP43155 626 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 RANBP1P43487 201 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 UBE2E1P51965 193 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF136P52737 540 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF138P52744 262 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 OR2B6P58173 313 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 C2orf80Q0P641 193 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 PMS2P3Q13401 168 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF266Q14584 549 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 SSX6Q7RTT6 188 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB43Q86YS6 212 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 DAW1Q8N136 415 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM234Q8WY98 164 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 CIB1Q99828 191 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 MED10Q9BTT4 135 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 PARVGQ9HBI0 331 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 CFL2Q9Y281 166 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 NUP160Q12769 1436 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA0556O60303 1618 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ADCY10Q96PN6 1610 aa3.52□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 C11orf94C9JXX5 98 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 PCK1P35558 622 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 P2RY2P41231 377 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 CDKN2BP42772 138 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 POU2AF1Q16633 256 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 HES5Q5TA89 166 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF691Q5VV52 312 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.51□□□□□ -1.85
SMARCA2-241ENST00000635397 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms