RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 REEP6Q96HR9 211 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PGAM5Q96HS1 289 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 TEAD3Q99594 435 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 OR10A2Q9H208 303 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 J3QLI3 93 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 EBAG9O00559 213 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 WIPF1O43516 503 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 FAM3AP98173 230 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 SCGB2A2Q13296 93 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 GID4Q8IVV7 300 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 FTMTQ8N4E7 242 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM163Q8TC26 289 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 MNTQ99583 582 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 CIB1Q99828 191 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 LRP12Q9Y561 859 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 ATRQ13535 2644 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 ACOD1A6NK06 481 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 A8MXK9 166 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PPIAL4DF5H284 164 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PHYHO14832 338 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 FAM20BO75063 409 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 EPHA2P29317 976 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 LCN2P80188 198 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 EFNB1P98172 346 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 OR8B8Q15620 311 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 SGK3Q96BR1 496 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 MROQ9BYG7 248 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 BRD7Q9NPI1 651 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN8-209ENST00000620074 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 M0R129 80 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF254O75437 659 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 DCTDP32321 178 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 PMELP40967 661 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 GSK3AP49840 483 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 ROM1Q03395 351 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 MPPED2Q15777 294 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF404Q494X3 552 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 ESCO2Q56NI9 601 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 CFAP161Q6P656 301 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 RFLNBQ8N5W9 214 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 OR8S1Q8NH09 359 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 MDFIQ99750 246 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 PKP2Q99959 881 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN8-209ENST00000620074 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms