RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.69■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ACOD1A6NK06 481 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PSMD9O00233 223 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF254O75437 659 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF205O95201 554 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM201AQ5SY85 155 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 MNTQ99583 582 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 MROQ9BYG7 248 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 S100A14Q9HCY8 104 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PNPP00491 289 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ACKR3P25106 362 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ALDH3A2P51648 485 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 LCN2P80188 198 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF404Q494X3 552 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 OR11L1Q8NGX0 322 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 MDFIQ99750 246 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CLN6Q9NWW5 311 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIAL4EA0A075B759 164 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A0G2JMP0 313 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A0X1KG70 313 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 A8MXK9 166 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIAL4DF5H284 164 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 FOXH1O75593 365 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 AVPP01185 164 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 WNT2P09544 360 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIAL4FP0DN26 164 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 IRF2P14316 349 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CPT2P23786 658 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 HTR1FP30939 366 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CXCR4P61073 352 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 MZT1Q08AG7 82 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR86Q86TI4 376 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CBR4Q8N4T8 237 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 EME1Q96AY2 570 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF7Q9UBF6 113 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIAL4AQ9Y536 164 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 MXRA5Q9NR99 2828 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A0U1RQV5 110 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 J3QLI3 93 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PHYHO14832 338 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 IGLV3-1P01715 115 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 GATA3P23771 443 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CDC42P60953 191 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 DCAF12L2Q5VW00 463 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 KRT74Q7RTS7 529 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 UBE2FQ969M7 185 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.65■□□□□ 0.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 CST4P01036 141 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 GRPP07492 148 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 SRP14P37108 136 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 EGR3Q06889 387 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 TMED1Q13445 227 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 SNCBQ16143 134 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 SSX6Q7RTT6 188 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 C11orf53Q8IXP5 236 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 OR8S1Q8NH09 359 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-217ENST00000590124 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms