RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 LANCL1O43813 399 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 MT-ND4P03905 459 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 TFPIP10646 304 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ICAM2P13598 275 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 LAP3P28838 519 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 BDKRB2P30411 391 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 HTR2BP41595 481 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 POU4F3Q15319 338 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PRR31Q5SQ13 230 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 GPX8Q8TED1 209 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 DOK4Q8TEW6 326 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ASB5Q8WWX0 329 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 HSD17B8Q92506 261 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 FAM46BQ96A09 425 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CRB3Q9BUF7 120 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 MYOTQ9UBF9 498 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 TCFL5Q9UL49 500 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 LRP12Q9Y561 859 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 AUP1Q9Y679 476 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 C11orf98E9PRG8 122 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 OIP5O43482 229 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CA11O75493 328 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 RP2O75695 350 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SLC22A5O76082 557 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 MAS1P04201 325 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CD74P04233 296 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ALDOBP05062 364 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CTSBP07858 339 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 GTF2F2P13984 249 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CTLA4P16410 223 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 RAB3AP20336 220 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CTSSP25774 331 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 KIR3DL2P43630 455 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SOX2P48431 317 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 HCCSP53701 268 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SOX8P57073 446 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CLRN1P58418 232 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ECH1Q13011 328 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 BAMBIQ13145 260 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZNF345Q14585 488 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 GRK1Q15835 563 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 M1APQ8TC57 530 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 ST7LQ8TDW4 575 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PP6455Q8WZ26 134 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SGCZQ96LD1 299 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-218ENST00000584243 SFXN2Q96NB2 322 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms