RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OCM2P0CE71 109 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A1P11166 492 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BTG1P62324 171 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF92Q03936 586 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6AP1Q15904 470 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TEX30Q5JUR7 227 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SHFQ7M4L6 423 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TEX29Q8N6K0 151 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 THEM6Q8WUY1 208 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A4Q9H015 551 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SP140LQ9H930 580 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GCM1Q9NP62 436 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BRD7Q9NPI1 651 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CD300LBA8K4G0 201 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 G3V2T6 193 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 H0YAE9 185 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 H3BMQ9 156 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM178BH3BS89 294 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 IFNL4K9M1U5 179 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MLNRO43193 412 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 XRCC2O43543 280 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TCF21O43680 179 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV2-70P01814 119 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PSKH1P11801 424 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR1AP12314 374 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CA6P23280 308 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 THBS2P35442 1172 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CX3CR1P49238 355 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB2A2Q13296 93 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SNAPC1Q16533 368 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TIGD6Q17RP2 521 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 FAM57BQ71RH2 274 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CPOQ8IVL8 374 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD6Q9BV23 337 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TOR3AQ9H497 397 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 LOC105371242A0A075B767 164 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf63A6NC05 138 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PPIAL4DF5H284 164 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SELENOFO60613 162 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 AVPP01185 164 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GRPP07492 148 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PPIAL4FP0DN26 164 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GATA3P23771 443 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 FASP25445 335 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CAPGP40121 348 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MMP16P51512 607 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BMXP51813 675 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CRISP1P54107 249 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CDK5Q00535 292 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MZT1Q08AG7 82 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MAB21L1Q13394 359 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZMYND11Q15326 602 aa7□□□□□ -1.29
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