RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 GJE1A6NN92 205 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 H3BRB1 525 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 CD33P20138 364 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 CD1BP29016 333 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MAPK8P45983 427 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 STC1P52823 247 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NFATC4Q14934 902 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 CDHR4A6H8M9 788 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2AG2A6NM03 316 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 IL2RAP01589 272 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 CTRLP40313 264 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NXPE1Q8N323 547 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR52L1Q8NGH7 329 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 SPSB1Q96BD6 273 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TBX5Q99593 518 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NMES1Q9C002 83 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PIGVQ9NUD9 493 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TBX21Q9UL17 535 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF716A6NP11 495 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TAPBPO15533 448 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PDYNP01213 254 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 DANCRP0C864 163 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF735P0CB33 412 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 CTSAP10619 480 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 THPOP40225 353 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NSDHLQ15738 373 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 VAMP3Q15836 100 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM225Q6GV28 225 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2T27Q8NH04 317 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 GPX8Q8TED1 209 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RRAGCQ9HB90 399 aa9.83□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1W2PRS3 328 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 HERV-K104P63124 156 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ACVR1Q04771 509 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PRDX4Q13162 271 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PPP1R1AQ13522 171 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 SHBQ15464 509 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TCTN1Q2MV58 587 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NIT1Q86X76 327 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 NEIL2Q969S2 332 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MIB2Q96AX9 1013 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TVP23CQ96ET8 276 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 SFRP2Q96HF1 295 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 VAMP8Q9BV40 100 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 GAGE12BA1L429 117 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 GNB3P16520 340 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PPIBP23284 216 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 UCP1P25874 307 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 FOXL2P58012 376 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 IL2P60568 153 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 GPM6BQ13491 265 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR8S1Q8NH09 359 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MS4A10Q96PG2 267 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MEMO1Q9Y316 297 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TBX19O60806 448 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 TNFSF15O95150 251 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 IGSF6O95976 241 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 POU2F2P09086 479 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM3AP98173 230 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF429Q86V71 674 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 RNF175Q8N4F7 328 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF563Q8TA94 476 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.6 ms