RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLGAP1O14490 977 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD80P33681 288 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS27P42677 84 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAD23AP54725 363 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCN1P1Q5VSP4 162 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COLCA1Q6ZS62 124 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGAP1Q75T13 922 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIGD4Q8IY51 512 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A28Q96A46 364 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EME1Q96AY2 570 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNJ15Q99712 375 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OPA3Q9H6K4 179 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.26■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNAB3O43448 404 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTNR1AP48039 350 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MMP16P51512 607 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL13RA1P78552 427 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AADACL4Q5VUY2 407 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2T2Q6IF00 324 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5AS1Q8N127 324 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR8G5Q8NG78 346 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM163Q8TC26 289 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBOAT4Q96T53 435 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM165Q9HC07 324 aa16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC182A6NF36 153 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R129 80 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAX2Q02962 417 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10S1Q8NGN2 331 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM100Q9NV29 134 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIOXQ9UGB7 285 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQCF6A8MYZ5 107 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XRCC2O43543 280 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FSTL3O95633 263 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYNP07948 512 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H2BFMP0C1H6 154 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRKXP51817 358 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATC1Q76KD6 591 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UPRTQ96BW1 309 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RDH12Q96NR8 316 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEAD3Q99594 435 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABHD6Q9BV23 337 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC22A4Q9H015 551 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GGT3PA6NGU5 568 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS2P15880 293 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEX2P28328 305 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CX3CR1P49238 355 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNB2P62879 340 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APOFQ13790 326 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LPCAT4Q643R3 524 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLBQ86Z14 1044 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THEM6Q8WUY1 208 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C8orf4Q9NR00 106 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms