RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SP140L	Q9H930	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DSCAM	O60469	2012 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459		H3BSA7	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SGCE	O43556	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PRKY	O43930	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SULT1C4	O75897	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TF	P02787	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF35	P13682	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EPHA2	P29317	976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MTNR1A	P48039	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EVX1	P49640	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RGS6	P49758	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ACTC1	P68032	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ACTA1	P68133	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PSG4	Q00888	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RAB40B	Q12829	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RAB35	Q15286	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SGCA	Q16586	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	COQ7	Q99807	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459		Q9H521	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RNF121	Q9H920	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	WDR76	Q9H967	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF878	C9JN71	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		H7C1C5	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		H7C1Q1	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SYNGR3	O43761	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HLA-H	P01893	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	LYN	P07948	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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