RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PNPOQ9NVS9 261 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RNF150Q9ULK6 438 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 KPTNQ9Y664 436 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 G3V3Y1 287 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RAB29O14966 203 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 UPK3AO75631 287 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ATG12O94817 140 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TXNDC12O95881 172 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 THY1P04216 161 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZNF44P15621 663 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 IVDP26440 423 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 S100GP29377 79 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MNDAP41218 407 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CDKN2DP55273 166 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DLK1P80370 383 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MS4A2Q01362 244 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PRPSAP1Q14558 356 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EXT1Q16394 746 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DEF8Q6ZN54 512 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAR1Q8WVX9 515 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OSTF1Q92882 214 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 IP6K3Q96PC2 410 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DPH7Q9BTV6 452 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CCDC32Q9BV29 185 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 REG4Q9BYZ8 158 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RASL12Q9NYN1 266 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 BTRCQ9Y297 605 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 V9GYS6 101 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GTI1 187 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TMEM72A0PK05 275 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SSNA1O43805 119 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MT-CO2P00403 227 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RLN1P04808 185 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR8U9P0C7N5 309 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FCGR1AP12314 374 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ADRA2CP18825 462 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 GZMHP20718 246 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 IDSP22304 550 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CERS1P27544 350 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ACVR1BP36896 505 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLC18A2Q05940 514 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 NAA40Q86UY6 237 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LGI3Q8N145 548 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SVBPQ8N300 66 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR4S2Q8NH73 311 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MRAPQ8TCY5 172 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LCN9Q8WX39 176 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PTH2Q96A98 100 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TECTBQ96PL2 329 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR5B12Q96R08 314 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 WDR76Q9H967 626 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms