RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	KDM8	Q8N371	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM156	Q8N614	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MED29	Q9NX70	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		H0YC42	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SYT7	O43581	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	EFNA2	O43921	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GMDS	O60547	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CBR3	O75828	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HTR3B	O95264	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MPZL1	O95297	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLDN1	O95832	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LPL	P06858	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	UMOD	P07911	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MELTF	P08582	738 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ITGA5	P08648	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	COX6A1	P12074	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GTF2F2	P13984	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF20	P17024	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB3A	P20336	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DNASE1	P24855	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GNAL	P38405	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	P2RY4	P51582	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MLF1	P58340	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GALK2	Q01415	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MEF2D	Q14814	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RHOV	Q96L33	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPAS1	Q99742	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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