RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 NRN1LQ496H8 165 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 RAB12Q6IQ22 244 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 GPX8Q8TED1 209 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SEH1LQ96EE3 360 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 FLVCR2Q9UPI3 526 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF292O60281 2723 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 PTPRBP23467 1997 aa15.3■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A096LPE4 126 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1W2PPZ6 126 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 GTF2F2P13984 249 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CPN1P15169 458 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 RAG2P55895 527 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CLN3Q13286 438 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 GSG1Q2KHT4 349 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CHST4Q8NCG5 386 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 OR8S1Q8NH09 359 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 PP6455Q8WZ26 134 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 REEP6Q96HR9 211 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 OR10A4Q9H209 315 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 BEX1Q9HBH7 125 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 C7orf66A4D0T2 115 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 RAB27BO00194 218 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SULT1C2O00338 296 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 LPLP06858 475 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 UBE2V2Q15819 145 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC54Q8NEL0 328 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 MED28Q9H204 178 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 GHITMQ9H3K2 345 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ING3Q9NXR8 418 aa15.29■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM14DPA8MWL7 114 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 TGM6O95932 706 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 VEGFCP49767 419 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 FAPQ12884 760 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 KISS1Q15726 138 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC00303Q3SY05 128 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6ZSR3 168 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 BEST4Q8NFU0 473 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 C10orf35Q96D05 121 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CMBLQ96DG6 245 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CHST5Q9GZS9 411 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 NOX3Q9HBY0 568 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM235A6NFC5 223 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF24P17028 368 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ACTBP60709 375 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ACTG1P63261 375 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 OR51J1Q9H342 316 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC22A20A6NK97 555 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 PEX14O75381 377 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CD3DP04234 171 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 AKAIN1P0CW23 69 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 PRF1P14222 555 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 RCVRNP35243 200 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CAMK2BQ13554 666 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 RTP5Q14D33 572 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6ZTK2 550 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM104Q8NE00 496 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 C12orf49Q9H741 205 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-204ENST00000519651 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MPIG6BO95866 241 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 FCGR2AP12318 317 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ACKR3P25106 362 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 STOMP27105 288 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 PRSS12P56730 875 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CDNFQ49AH0 187 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 AQP3Q92482 292 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms