RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GNRHR2Q96P88 292 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 KCNK17Q96T54 332 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C7orf66A4D0T2 115 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 A6NIZ1 184 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DISC1C4P0D8 188 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 S100A8P05109 93 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAD52P43351 418 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RIPPLY3P57055 190 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAP1BP61224 184 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN5P62079 268 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAP1AP62834 184 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DYRK1AQ13627 763 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAB11BQ15907 218 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 HACD4Q5VWC8 232 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZTK2 550 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF627Q7L945 461 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 COMMD2Q86X83 199 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CKLFQ9UBR5 152 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ARID1AO14497 2285 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ACOT7O00154 380 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CTDSPLO15194 276 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RBBP9O75884 186 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RLN1P04808 185 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 LPLP06858 475 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CLDN6P56747 220 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CLRN1P58418 232 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ROM1Q03395 351 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PCOLCEQ15113 449 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TEX30Q5JUR7 227 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 UEVLDQ8IX04 471 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR56B4Q8NH76 319 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ST7LQ8TDW4 575 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 S100PBPQ96BU1 408 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SPACA5Q96QH8 159 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 NOX3Q9HBY0 568 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 KIF25Q9UIL4 384 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 HHLA2Q9UM44 414 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GGT3PA6NGU5 568 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SULT1C2O00338 296 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TCAPO15273 167 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CTAG2O75638 210 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PRF1P14222 555 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AP3S2P59780 193 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MDS2Q8NDY4 140 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR2M3Q8NG83 312 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FAM46BQ96A09 425 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FGGYQ96C11 551 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RHOVQ96L33 236 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SFXN2Q96NB2 322 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR2M2Q96R28 347 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GHRLQ9UBU3 117 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ETV7Q9Y603 341 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 R4GMQ9 66 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 L7N2F9 121 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SULT2B1O00204 365 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A2O00624 439 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 XRCC3O43542 346 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 F10P00742 488 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 IGHMP01871 453 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CCL3P10147 92 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GTF2F2P13984 249 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SELENOPP49908 381 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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