RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 PRSS12P56730 875 aa14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 NAAAQ02083 359 aa14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 DRAM2Q6UX65 266 aa14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CDH20Q9HBT6 801 aa14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.58□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CADP27708 2225 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 FAM157BP0CG42 384 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CD40P25942 277 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SCN1BQ07699 218 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ASAH1Q13510 395 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CCDC58Q4VC31 144 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 FDX2Q6P4F2 183 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SOX7Q9BT81 388 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 POFUT1Q9H488 388 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 STARD10Q9Y365 291 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SIAH2O43255 324 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TTRP02766 147 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CSF3P09919 207 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 BDH1Q02338 343 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 BSPH1Q075Z2 132 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TPBGQ13641 420 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 GHSRQ92847 366 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 PGAM5Q96HS1 289 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SLC22A4Q9H015 551 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.57□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SMIM30A4D0T7 59 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 PLPP2O43688 288 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 MAGEB1P43366 347 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ERVS71-1P61550 626 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 INSL4Q14641 139 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 UFD1Q92890 307 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SMIM19Q96E16 107 aa14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 P2RY10O00398 339 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 IGFBP2P18065 325 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TAS2R43P59537 309 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ABHD4Q8TB40 342 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 LYZL4Q96KX0 146 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TMED9Q9BVK6 235 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 FABP12A6NFH5 140 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 HMX3A6NHT5 357 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CENPXA8MT69 81 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 APOC1P02654 83 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 EPXP11678 715 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SDC2P34741 201 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 KIR2DL3P43628 341 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CCR9P51686 369 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 DDI2Q5TDH0 399 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SGK3Q96BR1 496 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 A1L4Q6 167 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ABCD4O14678 606 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 SMPD2O60906 423 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CLDN1O95832 211 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 UCP2P55851 309 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 MADCAM1Q13477 382 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 CDK10Q15131 360 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 RADILQ96JH8 1075 aa14.54□□□□□ -0.08
NF1-211ENST00000487476 KCTD7Q96MP8 289 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms