RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 PRKACGP22612 351 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PRTN3P24158 256 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GRK5P34947 590 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CD200P41217 278 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 HMGA2P52926 109 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 BLVRAP53004 296 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ARF6P62330 175 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PAX8Q06710 450 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FOXL1Q12952 345 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 IKZF1Q13422 519 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 LCN8Q6JVE9 175 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DOK3Q7L591 496 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ERGIC1Q969X5 290 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SGK3Q96BR1 496 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD6Q9BV23 337 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TEX12Q9BXU0 123 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 OR10A2Q9H208 303 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SP140LQ9H930 580 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PRD5 423 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PRF3 423 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PRM7 423 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 C22orf46C9J442 243 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD9O00233 223 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DVL1O14640 695 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PHYHO14832 338 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GLCEO94923 617 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FAM107AO95990 144 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FSHBP01225 129 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 APOC1P02654 83 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 EGR1P18146 543 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEA2P43356 314 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GATA4P43694 442 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GSK3AP49840 483 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A1P53007 311 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 HCCSP53701 268 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CSNK2BP67870 215 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FLOT2Q14254 428 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MICBQ29980 383 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CD276Q5ZPR3 534 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SHFQ7M4L6 423 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KRT77Q7Z794 578 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CPOQ8IVL8 374 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TIGD4Q8IY51 512 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SPERTQ8NA61 448 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PIGCQ92535 297 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 LHX4Q969G2 390 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ASB9Q96DX5 294 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SEH1LQ96EE3 360 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 AMELYQ99218 206 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DDOQ99489 341 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CCL13Q99616 98 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CMC2Q9NRP2 79 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CTSZQ9UBR2 303 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF879B4DU55 563 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 CDIPTO14735 213 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 KCNAB3O43448 404 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFB3O43676 98 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 TFF1P04155 84 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 HMGN1P05114 100 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 LYNP07948 512 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-209ENST00000480420 T-ENOLP0DO92 83 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms