RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 BTG1P62324 171 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 POU4F2Q12837 409 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MPPED2Q15777 294 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OCLNQ16625 522 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN26Q16670 478 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SSX6Q7RTT6 188 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SPERTQ8NA61 448 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 Q8TCH9 128 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 RFKQ969G6 155 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R14AQ96A00 147 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 RAB39BQ96DA2 213 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PBOV1Q9GZY1 135 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 LPAR2Q9HBW0 351 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 GMPPBQ9Y5P6 360 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PNPP00491 289 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OR2T7P0C7T2 308 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 GABRB1P18505 474 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ACKR3P25106 362 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 EGR3Q06889 387 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 CHRFAM7AQ494W8 412 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 TMEM155Q4W5P6 130 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OR2T27Q8NH04 317 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 TBX5Q99593 518 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 UFSP2Q9NUQ7 469 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 AASSQ9UDR5 926 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF391Q9UJN7 358 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa17.61■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SVEP1Q4LDE5 3571 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 A0A0U1RQV5 110 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 DLGAP1O14490 977 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF205O95201 554 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MSMBP08118 114 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ANPEPP15144 967 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MDH2P40926 338 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 CR1LQ2VPA4 569 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 FAM120AOSQ5T036 256 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF684Q5T5D7 378 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PRIMA1Q86XR5 153 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PLPP7Q8NBV4 271 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OR51F2Q8NH61 342 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 TMEM186Q96B77 213 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SHARPINQ9H0F6 387 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 TMEM165Q9HC07 324 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 G6PC2Q9NQR9 355 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 FAM118AQ9NWS6 357 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.412e-27■□□□□ 8.5
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 LRRC30A6NM36 301 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PLPP2O43688 288 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 FAM20BO75063 409 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-1P01715 115 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1E1P36543 226 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 FAM201AQ5SY85 155 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ENTHD1Q8IYW4 607 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SPICQ8N5J4 248 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OR10H4Q8NGA5 316 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 BEX2Q9BXY8 128 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 HIF1ANQ9NWT6 349 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 R4GMQ9 66 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A6O15403 523 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MTNR1AP48039 350 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MZT1Q08AG7 82 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RCN1Q15293 331 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SNCBQ16143 134 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 KRT74Q7RTS7 529 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 WDR86Q86TI4 376 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 C1orf87Q8N0U7 546 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 OR11L1Q8NGX0 322 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 OR8S1Q8NH09 359 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RHOXF1Q8NHV9 184 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RNFT2Q96EX2 444 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 FN3KRPQ9HA64 309 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 C14orf119Q9NWQ9 140 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 F5H0A9 414 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PPIAL4DF5H284 164 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 J3QRE1 110 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 FSTL3O95633 263 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 CST4P01036 141 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 TTRP02766 147 aa17.57■□□□□ 0.4
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