RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA1FO60840 1977 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC5A10A0PJK1 596 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM168BA1KXE4 195 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01619G3V211 115 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CD8AP01732 235 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PET100P0DJ07 73 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CRISP2P16562 243 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB561P49447 251 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CAV2P51636 162 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGCS1Q01581 520 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 KDSRQ06136 332 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PSG5Q15238 335 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGGQ5H8A4 983 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL9Q6T311 187 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL13Q8N6R0 699 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8G5Q8NG78 346 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 DEC1Q9P2X7 70 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CD84Q9UIB8 345 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX24Q9Y343 169 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0J9YXV3 536 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA6L10A6NI86 522 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD1O60671 282 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT3HO75486 399 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 P01737 135 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R46P59540 309 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HERVK_113P61574 105 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKCDQ05655 676 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HERPUD1Q15011 391 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC14Q49A88 953 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF565Q8N9K5 539 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF488Q96MN9 340 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SPNS1Q9H2V7 528 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 DDIT4Q9NX09 232 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCY9O60503 1353 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCB11O95342 1321 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD50Q92878 1312 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CDIPTO14735 213 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2L11O43521 198 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAP1O75689 374 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR1DP28221 377 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CD70P32970 193 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNJ2BPP57105 145 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP107P57740 925 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP10-11P60412 298 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PITPNAQ00169 270 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB31Q13636 194 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HES5Q5TA89 166 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 HBMQ6B0K9 141 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 BBS7Q8IWZ6 715 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 UBA3Q8TBC4 463 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SFXN5Q8TD22 340 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEB18Q96M61 343 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 VAX2Q9UIW0 290 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TFR2Q9UP52 801 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GX12 115 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms