RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NOS1P29475 1434 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ADGRB3O60242 1522 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 LAMC1P11047 1609 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PTPN23Q9H3S7 1636 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 C1orf167Q5SNV9 1468 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SDK2Q58EX2 2172 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CEP152O94986 1710 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CT45A6P0DMU7 189 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CT45A5P0DMU8 189 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CT45A7P0DMV0 189 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CRISP1P54107 249 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DMC1Q14565 340 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PSMD5Q16401 504 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CT45A1Q5HYN5 189 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SLC16A14Q7RTX9 510 aa2.97□□□□□ -1.93
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SGCE-210ENST00000472326 OR7G2Q8NG99 324 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 OR1J4Q8NGS1 313 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 AKR7LQ8NHP1 331 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CT45A3Q8NHU0 189 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ZFP3Q96NJ6 502 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 RHBDL2Q9NX52 303 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SLC17A7Q9P2U7 560 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TMCC3Q9ULS5 477 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TRPM2O94759 1503 aa2.97□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 A0A0C4DFX4 3053 aa2.96□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NALCNQ8IZF0 1738 aa2.96□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 HEATR9A2RTY3 570 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PSMB5P28074 263 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TNFSF9P41273 254 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SIGLEC14Q08ET2 396 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SELENBP1Q13228 472 aa2.96□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SLC22A9Q8IVM8 553 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.96□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 RETNQ9HD89 108 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MED4Q9NPJ6 270 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TULP4Q9NRJ4 1543 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PIK3R4Q99570 1358 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CEACAM18A8MTB9 384 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SIRPB1O00241 398 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 IL32P24001 234 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TALDO1P37837 337 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TAS2R46P59540 309 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SEMG2Q02383 582 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 FAM53BQ14153 422 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CEP55Q53EZ4 464 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 XKR7Q5GH72 579 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 STUMQ69YW2 141 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SNX31Q8N9S9 440 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 OR4M1Q8NGD0 313 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 OR10G6Q8NH81 332 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.95□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ADGRL2O95490 1459 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RIMS2Q9UQ26 1411 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 NRAPQ86VF7 1730 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SYCE1LA8MT33 242 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PLIN3O60664 434 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CNMDO75829 334 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 LHBP01229 141 aa2.94□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 C22orf42Q6IC83 251 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa2.94□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ANKRA2Q9H9E1 313 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PRXQ9BXM0 1461 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PXDNQ92626 1479 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MTUS2Q5JR59 1369 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SMCO3A2RU48 225 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 H0Y8G0 127 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 NMT2O60551 498 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SERPINB7O75635 380 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PTMSP20962 102 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 OR1E1P30953 314 aa2.93□□□□□ -1.94
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