RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PNKDQ8N490 385 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 UHRF2Q96PU4 802 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ASCL2Q99929 193 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PDZD7Q9H5P4 517 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 CNIH4Q9P003 139 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 H2BFMP0C1H6 154 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 ST3GAL3Q11203 375 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DOK7Q18PE1 504 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TREML2Q5T2D2 321 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN2O60636 221 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ASGR2P07307 311 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 ECI1P42126 302 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 YPEL5P62699 121 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.61e-6■■■□□ 18.7
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PTPRC-209ENST00000442510 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01551Q86U37 167 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM56Q96MV1 263 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 ACTL6AO96019 429 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SRMP19623 302 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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