RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SEH1LQ96EE3 360 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 V9GYS6 101 aa20.27■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 RAB6AP20340 208 aa20.26■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 FCN2Q15485 313 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 DRAM2Q6UX65 266 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 RTN4RL2Q86UN3 420 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 GPX8Q8TED1 209 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.26■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNHIT1O43257 154 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 NBL1P41271 181 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2V2Q15819 145 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CHST4Q8NCG5 386 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM104Q8NE00 496 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MED28Q9H204 178 aa20.26■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PP11 408 aa20.25■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 ACTL6AO96019 429 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CD3DP04234 171 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CSF1P09603 554 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 ECH1Q13011 328 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 BCL2A1Q16548 175 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 NICN1Q9BSH3 213 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 OR51J1Q9H342 316 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 SMLR1H3BR10 107 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CAPZA1P52907 286 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 ST3GAL2Q16842 350 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 REEP6Q96HR9 211 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 BANF2Q9H503 90 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 BCO1Q9HAY6 547 aa20.25■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 PEX14O75381 377 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 TGM6O95932 706 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 LPLP06858 475 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 YES1P07947 543 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CEACAM1P13688 526 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 ACKR3P25106 362 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 PCBD1P61457 104 aa20.24■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF587BE7ETH6 402 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MPIG6BO95866 241 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 THBS4P35443 961 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 KISS1Q15726 138 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 Q6ZTK2 550 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.24■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM14DPA8MWL7 114 aa20.23■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 HPXP02790 462 aa20.23■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 LINC00470Q9BZP3 86 aa20.23■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 CHST5Q9GZS9 411 aa20.23■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 C12orf49Q9H741 205 aa20.23■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa20.23■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 ING3Q9NXR8 418 aa20.23■□□□□ 0.83
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FAAP20-209ENST00000428120 A6NJ64 397 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 WISP2O76076 250 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-HP01893 362 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 GNB3P16520 340 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 STOMP27105 288 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CRIP3Q6Q6R5 217 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CYYR1Q96J86 154 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 UPB1Q9UBR1 384 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 KLK13Q9UKR3 277 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 TM4SF5O14894 197 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 CLN3Q13286 438 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-209ENST00000428120 NOXA1Q86UR1 476 aa20.22■□□□□ 0.83
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