RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 GNALP38405 381 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CD200P41217 278 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ALDH3B1P43353 468 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CDH15P55291 814 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 TNK1Q13470 666 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SYS1Q8N2H4 156 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ADI1Q9BV57 179 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 JAM3Q9BX67 310 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 MED20Q9H944 212 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 DAPL1A0PJW8 107 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM210A6NLX4 147 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 H7C1Q1 480 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SELENOFO60613 162 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 GPANK1O95872 356 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SERPINA3P01011 423 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CST4P01036 141 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CFHR2P36980 270 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 MPV17P39210 176 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CCR9P51686 369 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 PRKXP51817 358 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CXCR4P61073 352 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CCL8P80075 99 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR8G1Q15617 311 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR8B8Q15620 311 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 TM4SF20Q53R12 229 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 LRP11Q86VZ4 500 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SPICQ8N5J4 248 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF525Q8N782 197 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 Q8TCH9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 RNF141Q8WVD5 230 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 REEP6Q96HR9 211 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC29A1Q99808 456 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 MICU1Q9BPX6 476 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR51B6Q9H340 312 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 LRP12Q9Y561 859 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 R4GMQ9 66 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 USF3Q68DE3 2245 aa7.56□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 B4DSR2 109 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SPRY3O43610 288 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CD5LO43866 347 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ENTPD6O75354 484 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 EPHA2P29317 976 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CAPGP40121 348 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 RANBP1P43487 201 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ERVS71-1P61550 626 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM3AP98173 230 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF92Q03936 586 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 GALEQ14376 348 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC58Q4VC31 144 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR2T2Q6IF00 324 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 Q6ZSR3 168 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM57BQ71RH2 274 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 DOK3Q7L591 496 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.55□□□□□ -1.2
PAICSP3-201ENST00000428007 OR8S1Q8NH09 359 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms