RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAB13P51153 203 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 BLCAPP62952 87 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 DGCR2P98153 550 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 AQP6Q13520 282 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCARB2Q14108 478 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR8G1Q15617 311 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 AANATQ16613 207 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCK2Q16822 640 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLA1AQ53H76 456 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ALG10Q5BKT4 473 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 STEAP3Q658P3 488 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDR86Q86TI4 376 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 Q8NFD4 153 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LIPHQ8WWY8 451 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPF1Q92782 380 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYDGFQ969H8 173 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MPP4Q96JB8 637 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF583Q96ND8 569 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RCHY1Q96PM5 261 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 WACQ9BTA9 647 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RMND5AQ9H871 391 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 HAO1Q9UJM8 370 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TCF19Q9Y242 345 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LYSTQ99698 3801 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TLDC2A0PJX2 215 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 A6NDX4 124 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TYROBPO43914 113 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SERPINB7O75635 380 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC22A3O75751 556 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRPP07492 148 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 IDO1P14902 403 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ECI1P42126 302 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC1A6P48664 564 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TGM4P49221 684 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 CTXN1P60606 82 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 CSNK2BP67870 215 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 ECH1Q13011 328 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLF10Q13118 480 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LSAMPQ13449 338 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 FHL1Q13642 323 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MEP1BQ16820 701 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 DGUOKQ16854 277 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MICBQ29980 383 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MESTQ5EB52 335 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 STUMQ69YW2 141 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 NAA40Q86UY6 237 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MKXQ8IYA7 352 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 MICU2Q8IYU8 434 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 DTX3Q8N9I9 347 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 FNDC8Q8TC99 324 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC29Q8WV35 223 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUDT11Q96G61 164 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 LYZL4Q96KX0 146 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC140Q96MF4 163 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 COQ7Q99807 217 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-398P-201ENST00000384143 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms