RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368207.7

PTPRK-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 4,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-203ENST00000368207 ADGRG3Q86Y34 549 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR5H15A6NDH6 313 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 XRCC3O43542 346 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 CCL3P10147 92 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SRD5A2P31213 254 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SNCAP37840 140 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF85Q03923 595 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 GAB4Q2WGN9 574 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 HAO2Q9NYQ3 351 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 DOCK6Q96HP0 2047 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 RAB27BO00194 218 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 S100PP25815 95 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF529Q6P280 563 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF573Q86YE8 665 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 DOK1Q99704 481 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 WFDC6Q9BQY6 131 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 C12orf10Q9HB07 376 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR5H8P0DN80 308 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SRPXP78539 464 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR5B12Q96R08 314 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 EMP3P54852 163 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 F2RL1P55085 397 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 CDONQ4KMG0 1287 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR1J1Q8NGS3 322 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 PP6455Q8WZ26 134 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 A0A1W2PPV4 95 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 H7C1Q1 480 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 C1QBP02746 253 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 GLRA1P23415 457 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 LINC00303Q3SY05 128 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 A0A1W2PQD3 144 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 IFNA10P01566 189 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 CLDN20P56880 219 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR52W1Q6IF63 320 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SCCPDHQ8NBX0 429 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 CMBLQ96DG6 245 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 LINC01387J3KSC0 135 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FCGR2CP31995 323 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 RPP30P78346 268 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 MC2RQ01718 297 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF718Q3SXZ3 478 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 LRRC30A6NM36 301 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 MT-CO2P00403 227 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 CCL2P13500 99 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 LTBRP36941 435 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SERPINF1P36955 418 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 CDC20Q12834 499 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ZNF721Q8TF20 911 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 VWCEQ96DN2 955 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FOXJ3Q9UPW0 622 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ACACAQ13085 2346 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 MMP15P51511 669 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 GPM6AP51674 278 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 FUT5Q11128 374 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 GSG1Q2KHT4 349 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 ALKBH6Q3KRA9 238 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 SLC51BQ86UW2 128 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 MFSD4AQ8N468 514 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 A0A0U1RQK1 487 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 LIPT2A6NK58 231 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-203ENST00000368207 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms