RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR35P0CG20 571 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2CBP62714 309 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2CAP67775 309 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT9Q9BW91 350 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 TERTO14746 1132 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ATF1P18846 271 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMP3Q9UQV4 416 aa21.8■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 MPGP29372 298 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NQO2P16083 231 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM162BQ5T6X4 162 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52N4Q8NGI2 321 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCL13O43927 109 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM157BP0CG42 384 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 AVPR2P30518 371 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ERHP84090 104 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 Q6ZNB5 142 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10G3Q8NGC4 313 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM96BQ9Y3D0 163 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GLB1P16278 677 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 SHHQ15465 462 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.79■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINE3A8MV23 424 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NOXO1Q8NFA2 376 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ANGPTL6Q8NI99 470 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 S1PR3Q99500 378 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR37O15354 613 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GALNT1O75752 331 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 YIF1AO95070 293 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CALCRP30988 508 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR119Q8TDV5 335 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LRP12Q9Y561 859 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LIMS3P0CW19 117 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LIMS4P0CW20 117 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP2Q05923 314 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1456Q9P272 454 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC18AA5D8T8 446 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALNT1Q00973 533 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXF1Q12946 379 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CLN3Q13286 438 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CST9Q5W186 159 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC18CQ8NCF0 446 aa21.78■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFB6O95139 128 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CSF2RBP32927 897 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 UBAC2Q8NBM4 344 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CXorf58Q96LI9 332 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIB1Q96RU8 372 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf10Q9HB07 376 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT1P04628 370 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALT1P15291 398 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CDAP32320 146 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 THBS4P35443 961 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CRYBB2P43320 205 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 SSX7Q7RTT5 188 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 OTOSQ8NHW6 89 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN15P56746 228 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTDAPP60985 99 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIAP62937 165 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 VAMP3Q15836 100 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 DMRTC1Q5HYR2 192 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD5Q9GZQ3 224 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GUL6 1792 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 SPP1P10451 314 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK5Q00535 292 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB108BQ8NET1 73 aa21.77■■□□□ 1.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMA4Q16363 1823 aa21.77■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMG1P04279 462 aa21.77■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 FAHP16930 419 aa21.77■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 MVB12AQ96EY5 273 aa21.77■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 C19orf43Q9BQ61 176 aa21.77■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 ST3GAL2Q16842 350 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 MOGAT2Q3SYC2 334 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF429Q86V71 674 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 TOLLIPQ9H0E2 274 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR31O00270 319 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 CEACAM5P06731 702 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT6P51993 359 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMD4Q96H15 378 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8B4Q96RC9 309 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 FPR2P25090 351 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 CCR5P51681 352 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS16P62249 146 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD1Q8N668 190 aa21.76■■□□□ 1.07
GNPTAB-201ENST00000299314 RAE1P78406 368 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms