RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 DBTP11182 482 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1E1P36543 226 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CD200P41217 278 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 AVPI1Q5T686 147 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 LIPNQ5VXI9 398 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 KRT74Q7RTS7 529 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 DHRSXQ8N5I4 330 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 C1orf159Q96HA4 380 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A4Q9H015 551 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 TMEM106BQ9NUM4 274 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 WIPI2Q9Y4P8 454 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 R4GMQ9 66 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 NF1P21359 2839 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 METTL15A6NJ78 407 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 GMDSO60547 372 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SULT1C4O75897 302 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CFL1P23528 166 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 GATA4P43694 442 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CHN2P52757 468 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 LMO4P61968 165 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MVKQ03426 396 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 TTC23Q5W5X9 447 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CYGBQ8WWM9 190 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 Q96MT0 163 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SVEP1Q4LDE5 3571 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP18.79■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.9
SYF2-201ENST00000236273 HIVEP2P31629 2446 aa18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SONP18583 2426 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CLDN25C9JDP6 229 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SRP9P49458 86 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 OR8G1Q15617 311 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MPPED2Q15777 294 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ELMOD2Q8IZ81 293 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 RORBQ92753 470 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ADI1Q9BV57 179 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF391Q9UJN7 358 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A13Q9Y226 551 aa18.78■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GTI1 187 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SNTNA6NMZ2 147 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 RPP14O95059 124 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 KRT8P05787 483 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 GNAO1P09471 354 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 IL5RAQ01344 420 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CDONQ4KMG0 1287 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 LAIR2Q6ISS4 152 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MOGAT3Q86VF5 341 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 YIPF7Q8N8F6 280 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CNIH3Q8TBE1 160 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 OR51E1Q8TCB6 317 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 HPS1Q92902 700 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 NARFLQ9H6Q4 476 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 OR52A1Q9UKL2 312 aa18.77■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 H0YAE9 185 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 TMEM178BH3BS89 294 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 IGHV2-70P01814 119 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 IGHA1P01876 353 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CAPGP40121 348 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 TP53I3Q53FA7 332 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZSR3 168 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CATSPERDQ86XM0 798 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 KLBQ86Z14 1044 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ACBD7Q8N6N7 88 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PLPP7Q8NBV4 271 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 GPR84Q9NQS5 396 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 SNX5Q9Y5X3 404 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 NPTNQ9Y639 398 aa18.76■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM20BO75063 409 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CST4P01036 141 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 OR12D2P58182 307 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ACTC1P68032 377 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ACTA1P68133 377 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 SLC3A1Q07837 685 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF181Q2M3W8 571 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 WDR86Q86TI4 376 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 C11orf53Q8IXP5 236 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 Q8TCH9 128 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 TFAP2CQ92754 450 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 RAB1CQ92928 201 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 MOB1AQ9H8S9 216 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms