RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudcd2Q9CQ48 157 aa14.5□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tlnrd1Q9ERE8 362 aa14.5□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nprl2Q9WUE4 380 aa14.5□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prps1l3G3UXL2 318 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptx3P48759 381 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sox1P53783 391 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prss43Q76HL1 382 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp790Q80ZX2 779 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prps1l1Q8C5R8 318 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Swsap1Q8VCI7 278 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr307Q8VFN8 313 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prps1Q9D7G0 318 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phospho2Q9D9M5 241 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap46E9Q2C0 2641 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp36B1AQJ2 1098 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8888J3QPX5 126 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adra2cQ01337 458 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PigvQ7TPN3 493 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1061Q7TR72 313 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Impad1Q80V26 356 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mospd3Q8BGG6 235 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpx4Q91XR9 253 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc19a3Q99PL8 488 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt9Q9R0N9 491 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv6-20A0A140T8P2 115 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp961E9Q4R5 444 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sod2P09671 222 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpp4P28843 760 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Utf1Q6J1H4 339 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med16Q6PGF3 828 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timd4Q6U7R4 343 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1115Q7TR53 326 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr885Q7TRE0 309 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nabp1Q8BGW5 198 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ube3dQ8BX13 368 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 0610009B22RikQ8R3W2 140 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lpcat3Q91V01 487 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nop16Q9CPT5 178 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ethe1Q9DCM0 254 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ak3Q9WTP7 227 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2afb3S4R1G7 115 aa14.49□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrnA0A075B668 197 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Obp1bA2AEP0 171 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1018A2ASV3 311 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14743A2BHD2 171 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21103E9Q2Q1 267 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r28L7N203 852 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ascl4M0QW46 144 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mst1P26928 716 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ly6fP35460 134 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lyg2Q3V1I0 213 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Drd1Q61616 446 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1216Q7TR05 311 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdhr3Q8BL00 831 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl2Q8BMK1 389 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt9Q8BVU5 350 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bhlhe41Q99PV5 410 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl14Q9D1I6 145 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrndQ9QUG3 179 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IqckD3YYL3 290 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r88E9Q235 316 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc18a3O35304 530 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Opn1mwO35599 359 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc2a1P17809 492 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 KitlgP20826 273 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FapP97321 761 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Azgp1Q64726 307 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr201Q7TS38 308 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk35Q80ZW0 539 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10283Q8C3L5 117 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apbb3Q8R1C9 486 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr702Q920Z2 318 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 D10Wsu102eQ9CX66 185 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox1B1APN4 224 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8126E9Q1N7 198 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou3f1P21952 449 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Casp3P70677 277 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fndc4Q3TR08 231 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epha6Q62413 1035 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1222Q7TR02 311 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr584Q8VGW0 319 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep41Q99NF3 373 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ShpkQ9D5J6 476 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AspdhQ9DCQ2 287 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf346Q9R0B7 294 aa14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mptx2D3YYJ7 219 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8356J3QPD3 205 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GzmmO08643 264 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad51dO55230 329 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabrg2P22723 474 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uba1yP31254 1058 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfsf9P41274 309 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DhpsQ3TXU5 369 aa14.47□□□□□ -0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1357Q7TQU7 313 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.7 ms