RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 TTMPQ5BVD1 217 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 OR2T2Q6IF00 324 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 ARPINQ7Z6K5 226 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 OR5AS1Q8N127 324 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 GJC3Q8NFK1 279 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 OR2T12Q8NG77 320 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 OR51A7Q8NH64 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 ZNF583Q96ND8 569 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 WDFY2Q96P53 400 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 TBX15Q96SF7 602 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 SLC22A4Q9H015 551 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 SIRPDQ9H106 197 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 PTTG3PQ9NZH4 202 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 CTSZQ9UBR2 303 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 RNF114Q9Y508 228 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 C5orf63A6NC05 138 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 MRASO14807 208 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 RER1O15258 196 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 NDUFA2O43678 99 aa4.54□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 SLC16A7O60669 478 aa4.54□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 TXNDC12O95881 172 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 IGHV1-69P01742 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 ACSM4P0C7M7 580 aa4.54□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 KRTAP10-3P60369 221 aa4.54□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 MAB21L1Q13394 359 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 RAB32Q13637 225 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 MAPRE2Q15555 327 aa4.54□□□□□ -1.68
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PDE4D-229ENST00000638939 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 TMEM100Q9NV29 134 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 TMCC3Q9ULS5 477 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-229ENST00000638939 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.53□□□□□ -1.68
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