RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 BORCS8Q96FH0 119 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 UCK1Q9HA47 277 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 A6NLC8 198 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AKAIN1P0CW23 69 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ANOS1P23352 680 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC6A1P30531 599 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CD96P40200 585 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AKR1C2P52895 323 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AKR1C1Q04828 323 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EGR3Q06889 387 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EXT1Q16394 746 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EMC4Q5J8M3 183 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NUBPLQ8TB37 319 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TTC9Q92623 222 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OXGR1Q96P68 337 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CA10Q9NS85 328 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EHFQ9NZC4 300 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TMEM82A0PJX8 343 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GABARAPH6UMI1 98 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 J3QRE1 110 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AGPAT2O15120 278 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 BET1O15155 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SIGLEC5O15389 551 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 COX6A1P12074 109 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SELEP16581 610 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MSR1P21757 451 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 THEM4Q5T1C6 240 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 STK35Q8TDR2 534 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ELP5Q8TE02 316 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HAVCR1Q96D42 359 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 U3KQA8 63 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CBR3O75828 277 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ABHD16AO95870 558 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TTRP02766 147 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GRK1Q15835 563 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ISXQ2M1V0 245 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR4K15Q8NH41 348 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 COL12A1Q99715 3063 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAD51DO75771 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IL10RAQ13651 578 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CDK10Q15131 360 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SP6Q3SY56 376 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SPTSSAQ969W0 71 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.64□□□□□ -1.35
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