RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619447.4

FGF1-215, Transcript of fibroblast growth factor 1, human

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene FGF1, Length 3,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGF1-215	ENST00000619447	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TNFSF15	O95150	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	BGLAP	P02818	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	GABRA1	P14867	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CBR1	P16152	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MST1	P26927	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	HSD11B1	P28845	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	THBS2	P35442	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	AKR1C2	P52895	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	EFNB1	P98172	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	LTB	Q06643	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	IL10RA	Q13651	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MEP1B	Q16820	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MEST	Q5EB52	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	WNT2B	Q93097	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SVIL	O95425	2214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MAS1	P04201	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TDGF1	P13385	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	GDF1	P27539	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MTNR1B	P49286	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CYB561	P49447	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SLC25A1	P53007	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MYBPH	Q13203	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PLPP3	O14495	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	EFS	O43281	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	IGHG1	P01857	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CCL3	P10147	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PPP3CB	P16298	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ACP1	P24666	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	GDNF	P39905	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	P2RY4	P51582	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	FMOD	Q06828	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGF1-215	ENST00000619447	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms