RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 RPS27P42677 84 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 PDCD1Q15116 288 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 RNF148Q8N7C7 305 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 SPERTQ8NA61 448 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 DYRK2Q92630 601 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 DDOQ99489 341 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf123Q9NWV4 160 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 ADA2Q9NZK5 511 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 FCN3O75636 299 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 PYCR1P32322 319 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 IFNGR2P38484 337 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 DRAM2Q6UX65 266 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF826PQ6ZT77 177 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 LHX4Q969G2 390 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 LHBP01229 141 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 GYPAP02724 150 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 GRPP07492 148 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP10-3P60369 221 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN31Q12999 210 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf91Q3C1V1 193 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 FAM90A1Q86YD7 464 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 GCSAMQ8N6F7 178 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 TVP23AA6NH52 213 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 M0QZ24 198 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 PSKH1P11801 424 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 ARF6P62330 175 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 CYB561A3Q8NBI2 242 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 MMP27Q9H306 513 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 RNF114Q9Y508 228 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 A6NLC8 198 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHE40O14503 412 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 DVL1O14640 695 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM23O14925 209 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 GPR137BO60478 399 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV4-59P01825 116 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 RRM2P31350 389 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 MZT1Q08AG7 82 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 TEX36Q5VZQ5 186 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 LDLRAD3Q86YD5 345 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 OR2T4Q8NH00 348 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01006Q8NI28 216 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 OPA3Q9H6K4 179 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 C14orf119Q9NWQ9 140 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 KAAG1Q9UBP8 84 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0U1RQK1 487 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 IER3P46695 156 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 PRKXP51817 358 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 POU4F2Q12837 409 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 COPS4Q9BT78 406 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CNTD2Q9H8S5 307 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CLPXO76031 633 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 FABP3P05413 133 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A1P11166 492 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 PRDX6P30041 224 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 PCK2Q16822 640 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 LNX2Q8N448 690 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SCCPDHQ8NBX0 429 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SPSB4Q96A44 273 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ15Q99712 375 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 KPTNQ9Y664 436 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 HSD17B1P14061 328 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 DDOSTP39656 456 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 PROK1P58294 105 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CDONQ4KMG0 1287 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf53Q8IXP5 236 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.55■□□□□ 0.88
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