RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ZIC5Q96T25 663 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NAT8Q9UHE5 227 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ACHEP22303 614 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN12P56749 244 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF383Q8NA42 475 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 APC2O95996 2303 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TYMSP04818 313 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CD14P08571 375 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FCGR2CP31995 323 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CEACAM3P40198 252 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ADOQ96SZ5 270 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 POMT2Q9UKY4 750 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GZMKP49863 264 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FADS6Q8N9I5 356 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SFTA3P0C7M3 94 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GDE1Q9NZC3 331 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TCFL5Q9UL49 500 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CDK2AP1O14519 115 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF766Q5HY98 468 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PSMG4Q5JS54 123 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LIPIQ6XZB0 460 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 WBP2Q969T9 261 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 AQP7O14520 342 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LYG2Q86SG7 212 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT16Q8N428 558 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR52I2Q8NH67 350 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 HTR1DP28221 377 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM65Q6PI78 240 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 NTSR1P30989 418 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MEOX2P50222 304 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EDDM3BP56851 147 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SERF2P84101 59 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SYPL1Q16563 259 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 USP22Q9UPT9 525 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LDB3O75112 727 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FAM87AP0C7U9 286 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 GPX2P18283 190 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC18Q8N456 261 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 CLDND1Q9NY35 253 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 USP54Q70EL1 1684 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 STRCQ7RTU9 1775 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CTSLP07711 333 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 YPEL5P62699 121 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GNB1P62873 340 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ADIPOQQ15848 244 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SSX1Q16384 188 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.36□□□□□ -1.39
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