RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1B0GW55	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GGT3P	A6NGU5	568 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DVL1	O14640	695 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GMDS	O60547	372 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	HLA-DQA2	P01906	255 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GRP	P07492	148 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909		Q6ZSV7	163 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ST8SIA4	Q92187	359 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	IFT27	Q9BW83	186 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SLC22A4	Q9H015	551 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ADA2	Q9NZK5	511 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DUX4	Q9UBX2	424 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909		A6NLC8	198 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	NDUFA2	O43678	99 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	LHB	P01229	141 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	NOS3	P29474	1203 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	PYCR1	P32322	319 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	NUDT2	P50583	147 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	WDR86	Q86TI4	376 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	LNX2	Q8N448	690 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SPTSSA	Q969W0	71 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909		V9GYQ6	96 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	NOTCH1	P46531	2555 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	TVP23A	A6NH52	213 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GADD45G	O95257	159 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SEMG1	P04279	462 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SLC2A1	P11166	492 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	DLX1	P56177	255 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SPIB	Q01892	262 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	KRT72	Q14CN4	511 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	PCK2	Q16822	640 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	CDON	Q4KMG0	1287 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GLYAT	Q6IB77	296 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	CCL13	Q99616	98 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	KPTN	Q9Y664	436 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RPS5-208	ENST00000599909	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	BHLHE40	O14503	412 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	IDH3B	O43837	385 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF823	P16415	610 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	GSS	P48637	474 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	PRKX	P51817	358 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	PSME3	P61289	254 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	CSNK2B	P67870	215 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	KLRD1	Q13241	179 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	WDR38	Q5JTN6	314 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	DRAM2	Q6UX65	266 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	RNF148	Q8N7C7	305 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	SPERT	Q8NA61	448 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RPS5-208	ENST00000599909	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		9.21	□□□□□ -0.94

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