RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF9Q16594 264 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 BTN2A1Q7KYR7 527 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A1Q86YD7 464 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP7Q8NBV4 271 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SCCPDHQ8NBX0 429 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA2O43678 99 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10H3O60404 316 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 POU4F2Q12837 409 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYATL3Q5SZD4 288 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QL4Q86Z23 238 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFRL1Q8N441 504 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PIP4P2Q8N4L2 257 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GCSAMQ8N6F7 178 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT27Q9BW83 186 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM36Q9NQ86 728 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 WNK1Q9H4A3 2382 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GGT3PA6NGU5 568 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A31A6NKX4 558 aa21.15■□□□□ 0.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 GRPP07492 148 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PSKH1P11801 424 aa21.15■□□□□ 0.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GW55 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NLC8 198 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L2P0CJ85 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L3P0CJ86 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L4P0CJ87 422 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L5P0CJ88 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L6P0CJ89 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L7P0CJ90 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 NOS3P29474 1203 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CBX1P83916 185 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZSV7 163 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF7L1Q9HCS4 588 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCD2Q9UBJ2 740 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX4Q9UBX2 424 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT2P50583 147 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GYS2P54840 703 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT72Q14CN4 511 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX36Q5VZQ5 186 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYATQ6IB77 296 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 LNX2Q8N448 690 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 OR56B2PQ8NGI1 322 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ST8SIA4Q92187 359 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ECDO95905 644 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 LHBP01229 141 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF823P16415 610 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 PYCR1P32322 319 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CDONQ4KMG0 1287 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPD4Q6UWN0 246 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNRF4Q8WWF5 429 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTD2Q9H8S5 307 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KAAG1Q9UBP8 84 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 V9GYQ6 96 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TVP23AA6NH52 213 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAB1O14561 156 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GADD45GO95257 159 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SPIBQ01892 262 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DRAM2Q6UX65 266 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SPERTQ8NA61 448 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DPAGT1Q9H3H5 408 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KPTNQ9Y664 436 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHE40O14503 412 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMG1P04279 462 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A1P11166 492 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 PCK2Q16822 640 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf91Q3C1V1 193 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR86Q86TI4 376 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf95Q9H693 158 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVI7 797 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 IDH3BO43837 385 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GSSP48637 474 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 PSME3P61289 254 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf53Q8IXP5 236 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB561A3Q8NBI2 242 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6G5BQ8NDX9 201 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
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